43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2787 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  59.79 
 
 		 279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.6 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.04 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  51.61 
 
 		 286 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  47.66 
 
 		 140 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.06 
 
 		 142 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.7 
 
 		 156 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.44 
 
 		 144 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  39.09 
 
 		 156 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  31.67 
 
 		 172 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.96 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  33.64 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  35.54 
 
 		 152 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  32.06 
 
 		 159 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.430581 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36 
 
 		 406 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.34 
 
 		 185 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  33.9 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  31.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  27.22 
 
 		 182 aa  52  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2669  hypothetical protein  30.23 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167902  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0506  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.04 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  33.05 
 
 		 194 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.96 
 
 		 394 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.61 
 
 		 165 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3949  hypothetical protein  28.23 
 
 		 175 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  31.2 
 
 		 413 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.51 
 
 		 143 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  25.83 
 
 		 142 aa  46.2  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  30.25 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  29.69 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  26.92 
 
 		 147 aa  45.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  32.69 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  24.68 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  31.36 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0891  nucleotide deoxyribosyltransferase  33.77 
 
 		 154 aa  43.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  26.5 
 
 		 200 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1568  hypothetical protein  30.91 
 
 		 182 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  25.56 
 
 		 161 aa  42.4  0.009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0101154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>