46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0878 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  83.57 
 
 		 156 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  41.48 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.55 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.2 
 
 		 297 aa  90.1  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.52 
 
 		 286 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.44 
 
 		 293 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.44 
 
 		 279 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.52 
 
 		 276 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  36.23 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.430581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  32.21 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  28.67 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.14 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  32.37 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.67 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  32.71 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.56 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  32.23 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  32.23 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  32.28 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  37.76 
 
 		 413 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  31.62 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0547  hypothetical protein  28.69 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.33 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.29 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.46 
 
 		 394 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  35.24 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.59 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  34 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  33.65 
 
 		 172 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  36.49 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  29.41 
 
 		 194 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  30.08 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  33.93 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  33.93 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  26.88 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.69 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.76 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  27.97 
 
 		 250 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0506  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.48 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.3 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  30.77 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>