50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2000 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  284  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  56.34 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.85 
 
 		 286 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.66 
 
 		 293 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  49.25 
 
 		 276 aa  110  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.48 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.43 
 
 		 297 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.13 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.09 
 
 		 279 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  35.16 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  36.28 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  31.39 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  31.13 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.4 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.96 
 
 		 406 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  37.61 
 
 		 413 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.15 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.15 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  28.24 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.04 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  32.17 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.2 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  28.46 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.04 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0891  nucleotide deoxyribosyltransferase  29.71 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  30.3 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  32.2 
 
 		 172 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.93 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  30.16 
 
 		 194 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  28.03 
 
 		 250 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  30.25 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  29.76 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.430581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.45 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.51 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.44 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  26.85 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.58 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.3 
 
 		 394 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.93 
 
 		 213 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.04 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  33.03 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.3 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.97 
 
 		 161 aa  42  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0101154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.57 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2681  hypothetical protein  23.08 
 
 		 227 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  32.67 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  33.65 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  28.91 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>