40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0694 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  91.88 
 
 		 161 aa  306  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  85.62 
 
 		 161 aa  292  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  53.8 
 
 		 207 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.94 
 
 		 208 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.8 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  59.71 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.06 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  53.42 
 
 		 172 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.53 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  52.9 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.72 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.53 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.97 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.23 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.67 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.67 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.67 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.18 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.36 
 
 		 213 aa  99  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.18 
 
 		 185 aa  91.3  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.49 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.29 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.49 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.97 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.97 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  32.35 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  34.44 
 
 		 192 aa  73.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.93 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.96 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.63 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.12 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  31.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  29.1 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  35.58 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31 
 
 		 142 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.34 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.96 
 
 		 279 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.96 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>