50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0225 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 276 aa  563  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.88 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.48 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.04 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  48.73 
 
 		 286 aa  258  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  49.25 
 
 		 140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.37 
 
 		 142 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.71 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.52 
 
 		 144 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  29.32 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.15 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0891  nucleotide deoxyribosyltransferase  25.36 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  30.09 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  37.04 
 
 		 172 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  27.12 
 
 		 154 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1568  hypothetical protein  32.48 
 
 		 182 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.19 
 
 		 165 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.26 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0506  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.86 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  32.76 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2669  hypothetical protein  31.31 
 
 		 169 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167902  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.32 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  30.6 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.1 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0547  hypothetical protein  29.36 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.88 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3949  hypothetical protein  32.14 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0649  Protein of unknown function DUF2297  29.63 
 
 		 172 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  28.81 
 
 		 152 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.3 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  29.41 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  34.34 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.09 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  31.13 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.430581 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  33.88 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.73 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.35 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  25.86 
 
 		 152 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  29.31 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0389  hypothetical protein  36 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.28 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1101  hypothetical protein  30.91 
 
 		 149 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.9 
 
 		 208 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>