29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0992 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  80.13 
 
 
152 aa  261  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  78.81 
 
 
152 aa  255  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  74.03 
 
 
154 aa  241  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  53.29 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  52 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.9 
 
 
155 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  52.98 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  52.32 
 
 
156 aa  169  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  28.48 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.79 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.12 
 
 
276 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.59 
 
 
286 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.71 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.71 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  26.72 
 
 
297 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  27.52 
 
 
413 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  26.92 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  26.27 
 
 
279 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  25.78 
 
 
172 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  24.41 
 
 
194 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  22.83 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1455  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  25.86 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.241944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2681  hypothetical protein  34.78 
 
 
227 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  26.72 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  26.28 
 
 
200 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0547  hypothetical protein  28.04 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>