30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1703 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  80 
 
 
156 aa  256  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  70.2 
 
 
155 aa  233  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  59.6 
 
 
156 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  58.67 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  52 
 
 
154 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  53.29 
 
 
152 aa  176  8e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  51.97 
 
 
152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  31.58 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.3 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.88 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.45 
 
 
297 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  29.25 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.2 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  30.89 
 
 
413 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.93 
 
 
286 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.76 
 
 
276 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  30.65 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.97 
 
 
293 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.28 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3058  hypothetical protein  32.63 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  37.7 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  32.06 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  31.75 
 
 
200 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.4 
 
 
279 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.28 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.55 
 
 
208 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  32.67 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.13 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>