22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0124 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  97.44 
 
 		 156 aa  313  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  62.99 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  58.17 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  58.67 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  53.64 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  53.64 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  52.98 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  50.68 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.37 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.63 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  29.55 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.23 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  28.12 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  42.11 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  27.42 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.36 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.5 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.18 
 
 		 297 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.36 
 
 		 293 aa  44.3  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  34.29 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  30.84 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>