29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_10671 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  310  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  95.39 
 
 
152 aa  299  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  80.13 
 
 
154 aa  261  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  75.5 
 
 
154 aa  244  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  54.3 
 
 
156 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  53.29 
 
 
155 aa  176  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  54.97 
 
 
156 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  53.64 
 
 
156 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.36 
 
 
155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.3 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.55 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  28.48 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.66 
 
 
297 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.59 
 
 
286 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.21 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.86 
 
 
276 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.12 
 
 
279 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  25.86 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  29.36 
 
 
413 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  25.78 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.93 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  27.78 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  34.62 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  25.2 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  27.69 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.78 
 
 
208 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.84 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  26.96 
 
 
172 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0891  nucleotide deoxyribosyltransferase  30.77 
 
 
154 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>