26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2835 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.33 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  39.5 
 
 		 145 aa  87.8  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  38.52 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.23 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.17 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.67 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  30.25 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.67 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  31.39 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.21 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2681  hypothetical protein  31.14 
 
 		 227 aa  60.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  28.82 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.3 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  32.81 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  31.03 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  33.06 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.5 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  32.06 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.89 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  33.06 
 
 		 156 aa  44.3  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0547  hypothetical protein  25.32 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  25.78 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  25.78 
 
 		 154 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>