47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1343 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 142 aa  290  6e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  56.34 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  48.48 
 
 		 286 aa  124  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50 
 
 		 297 aa  120  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.59 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.55 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.37 
 
 		 276 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.73 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.06 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  38.33 
 
 		 172 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  38.84 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  34.59 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  32.59 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  37.5 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  32.58 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.46 
 
 		 406 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  29.63 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.17 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  29.41 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.4 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.5 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.6 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.81 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  29.9 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  26.09 
 
 		 250 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.09 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  26.89 
 
 		 194 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.36 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  28.3 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.17 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.18 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.53 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  31.82 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.95 
 
 		 394 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.91 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  26.05 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  25.69 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31 
 
 		 161 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.84 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  26.24 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.09 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  29.84 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  27.36 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.430581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>