27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1923 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  30.15 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.46 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  34.09 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  36.63 
 
 		 413 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  30.77 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.48 
 
 		 394 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.56 
 
 		 406 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.6 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  33.06 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2515  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.23 
 
 		 395 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.47 
 
 		 279 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  25.83 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  33.01 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.59 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.57 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.91 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.27 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  32.11 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.46 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.96 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.51 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.27 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  32.08 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>