39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0745 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  85.62 
 
 		 161 aa  292  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  83.85 
 
 		 161 aa  289  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  61.87 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  53.8 
 
 		 207 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.56 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.8 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  53.42 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.43 
 
 		 173 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.8 
 
 		 172 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.72 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  55.07 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.22 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.65 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.87 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.44 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.48 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.82 
 
 		 194 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.69 
 
 		 188 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.36 
 
 		 213 aa  97.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.38 
 
 		 185 aa  94  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.6 
 
 		 203 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.58 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.41 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  36.24 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.31 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.15 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  29.82 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.25 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.28 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.61 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.05 
 
 		 279 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  27.03 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  33.65 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.32 
 
 		 276 aa  41.2  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.08 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>