34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0637 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  362  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  70.52 
 
 		 173 aa  244  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  65.52 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.49 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.44 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  57.41 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  53.89 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  57.04 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  59.15 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.53 
 
 		 161 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  51.27 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  54.72 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.1 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.91 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.64 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.22 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.24 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.95 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.59 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.06 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.04 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.87 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.06 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  35.36 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.38 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.18 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.06 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.94 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  34.34 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.61 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.18 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.53 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.78 
 
 		 142 aa  41.2  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>