28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0039 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.85 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.34 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  36.14 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.43 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.92 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  37.3 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.3 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.57 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.29 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.61 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  35.65 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  39.05 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.93 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.21 
 
 
172 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.73 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  36.28 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.27 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.48 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.5 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.81 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.59 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.96 
 
 
161 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.25 
 
 
162 aa  54.7  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  26.95 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.54 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.17 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>