34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4306 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  77.54 
 
 		 187 aa  291  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  70.88 
 
 		 186 aa  265  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  64.86 
 
 		 188 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  51.12 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.81 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.28 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  48.67 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.33 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.49 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  39.68 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.02 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  47.97 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.62 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.33 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.91 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  47.65 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.27 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.97 
 
 		 161 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.98 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.95 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.61 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  41.78 
 
 		 166 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.78 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.67 
 
 		 160 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.14 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.84 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  31.18 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.5 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.1 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.91 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  32.04 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>