33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1021 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  77.54 
 
 		 189 aa  291  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  69.61 
 
 		 186 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  66.67 
 
 		 188 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.43 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50 
 
 		 203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.73 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  41.4 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.01 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.33 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.33 
 
 		 196 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  47.22 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.53 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  43.75 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.37 
 
 		 186 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.06 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.44 
 
 		 161 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.74 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  43.45 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.76 
 
 		 172 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.31 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.06 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.67 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.87 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  41.55 
 
 		 166 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.86 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.16 
 
 		 173 aa  88.6  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.82 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.56 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  30.41 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.48 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.13 
 
 		 286 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.07 
 
 		 297 aa  42.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>