43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3363 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.94 
 
 
162 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.18 
 
 
194 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.69 
 
 
208 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  44.13 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.44 
 
 
176 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  42.5 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.21 
 
 
172 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.25 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.11 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.49 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.08 
 
 
188 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.25 
 
 
186 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.31 
 
 
187 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.8 
 
 
173 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.28 
 
 
183 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.42 
 
 
213 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.61 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  40.38 
 
 
161 aa  94.4  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.18 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.42 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.46 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  31.65 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.93 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.91 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.54 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.65 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.47 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  31.01 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.08 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.26 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.34 
 
 
293 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  29.81 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.33 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.35 
 
 
286 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.3 
 
 
276 aa  45.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  26.85 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.09 
 
 
297 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  25.86 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.68 
 
 
156 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30 
 
 
165 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>