21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4043 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 394 aa  769    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2515  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  71.07 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.75 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2512  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.24 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.94 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4040  hypothetical protein  44.25 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  37.65 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0333  hypothetical protein  37.26 
 
 		 387 aa  149  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0203  hypothetical protein  34.94 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1600  PfkB family carbohydrate kinase  29.29 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.744108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.48 
 
 		 142 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  33.93 
 
 		 147 aa  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.96 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  26.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3641  pfkB family carbohydrate kinase  28.87 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.17 
 
 		 142 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.46 
 
 		 144 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  30.3 
 
 		 140 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  34.74 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.09 
 
 		 143 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>