28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0656 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  323  6e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  80 
 
 
155 aa  256  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  67.76 
 
 
155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  58.82 
 
 
156 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  58.17 
 
 
156 aa  201  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  53.29 
 
 
154 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  54.97 
 
 
152 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  51.68 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  52.32 
 
 
152 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.06 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  31.58 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.3 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.62 
 
 
297 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  31.67 
 
 
413 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  28.97 
 
 
147 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.05 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.36 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.25 
 
 
293 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  29.27 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3058  hypothetical protein  35.23 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  33.06 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.73 
 
 
286 aa  43.9  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.31 
 
 
276 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.08 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.56 
 
 
406 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  28.91 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>