More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_75631 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_10901  hypothetical glycine cleavage system P protein (Eurofung)  54.05 
 
 		 1058 aa  1025    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0302112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02735  glycine dehydrogenase  49.29 
 
 		 957 aa  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.168322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0789  glycine dehydrogenase  49.29 
 
 		 957 aa  878    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0988  glycine dehydrogenase  50.2 
 
 		 951 aa  874    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5192  glycine dehydrogenase  49.74 
 
 		 957 aa  887    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1305  glycine dehydrogenase  47.91 
 
 		 955 aa  888    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0619  glycine dehydrogenase  49.17 
 
 		 962 aa  894    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75631  Glycine cleavage system protein  100 
 
 		 1033 aa  2141    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0870  glycine dehydrogenase  50.21 
 
 		 956 aa  906    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597554  normal  0.602316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3295  glycine dehydrogenase  49.8 
 
 		 982 aa  880    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3209  glycine dehydrogenase  49.38 
 
 		 962 aa  903    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3312  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 975 aa  894    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1276  glycine dehydrogenase  50.26 
 
 		 965 aa  927    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3846  glycine dehydrogenase  51.08 
 
 		 956 aa  941    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0725  glycine dehydrogenase  46.79 
 
 		 932 aa  822    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0781  glycine dehydrogenase  49.18 
 
 		 962 aa  897    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1276  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 954 aa  890    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42567  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26284  predicted protein  51.59 
 
 		 976 aa  965    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0122884  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3398  glycine dehydrogenase  48.15 
 
 		 952 aa  874    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0619508  normal  0.284605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1936  glycine dehydrogenase  49.03 
 
 		 964 aa  862    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0995086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2377  glycine dehydrogenase  48.51 
 
 		 938 aa  860    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2685  glycine dehydrogenase  48.27 
 
 		 964 aa  839    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2993  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 975 aa  894    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18581  glycine dehydrogenase  45.12 
 
 		 969 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3062  glycine dehydrogenase  48.21 
 
 		 962 aa  897    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01070  glycine dehydrogenase mitochondrial precursor, putative  51.41 
 
 		 1047 aa  960    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1096  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 954 aa  885    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0796  glycine dehydrogenase  48.6 
 
 		 965 aa  880    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.477642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2465  glycine dehydrogenase  48 
 
 		 963 aa  881    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421372  normal  0.628025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1398  glycine dehydrogenase  49.69 
 
 		 957 aa  899    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.67826  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1267  glycine dehydrogenase  48.02 
 
 		 968 aa  894    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3331  glycine dehydrogenase  50.51 
 
 		 976 aa  904    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2871  glycine dehydrogenase  47.03 
 
 		 948 aa  844    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1284  glycine dehydrogenase  50.16 
 
 		 954 aa  874    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.140607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2762  glycine dehydrogenase  50.55 
 
 		 974 aa  983    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0129  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 975 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3929  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 975 aa  894    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0910742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4392  glycine dehydrogenase  49.49 
 
 		 950 aa  884    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5426  glycine dehydrogenase  48.72 
 
 		 957 aa  853    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447086  normal  0.0408977 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2195  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 956 aa  906    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3323  glycine dehydrogenase  50.76 
 
 		 975 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1345  glycine dehydrogenase  51.13 
 
 		 950 aa  892    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2188  glycine dehydrogenase  48.67 
 
 		 958 aa  892    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3322  glycine dehydrogenase  48.98 
 
 		 957 aa  879    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2538  glycine dehydrogenase  49.28 
 
 		 960 aa  895    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1094  glycine dehydrogenase  46.74 
 
 		 931 aa  833    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0703141  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2297  glycine dehydrogenase  49.48 
 
 		 956 aa  894    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1760  glycine dehydrogenase  44.74 
 
 		 969 aa  800    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2047  glycine dehydrogenase  52.12 
 
 		 953 aa  937    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0445  glycine dehydrogenase  51.03 
 
 		 949 aa  942    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3959  glycine dehydrogenase  48.52 
 
 		 970 aa  863    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0444417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4865  glycine dehydrogenase  51.49 
 
 		 964 aa  963    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3253  glycine dehydrogenase  50.92 
 
 		 975 aa  919    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28901  glycine dehydrogenase  47.14 
 
 		 982 aa  873    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.624172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4065  glycine dehydrogenase  44.46 
 
 		 1072 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3740  glycine dehydrogenase  50 
 
 		 964 aa  904    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3622  glycine dehydrogenase  50.05 
 
 		 943 aa  914    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290063  normal  0.0837915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3021  glycine dehydrogenase  49.44 
 
 		 967 aa  840    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2476  glycine dehydrogenase  47.56 
 
 		 964 aa  861    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1568  glycine dehydrogenase  49.64 
 
 		 957 aa  882    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.34808  decreased coverage  0.000847802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1866  glycine dehydrogenase  47.17 
 
 		 1014 aa  830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276293  normal  0.279729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0054  glycine dehydrogenase  50.15 
 
 		 978 aa  907    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0835  glycine dehydrogenase  49.59 
 
 		 984 aa  914    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1731  glycine dehydrogenase  49.8 
 
 		 964 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0573168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1811  glycine dehydrogenase  50.81 
 
 		 966 aa  932    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1618  glycine dehydrogenase  50.15 
 
 		 958 aa  893    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89287  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0803  glycine dehydrogenase  48.71 
 
 		 965 aa  883    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231271  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3482  glycine dehydrogenase  50.26 
 
 		 974 aa  905    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1431  glycine dehydrogenase  47.64 
 
 		 1003 aa  848    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.961766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1907  glycine dehydrogenase  52.42 
 
 		 954 aa  945    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0543112  normal  0.0739676 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2391  glycine dehydrogenase  49.22 
 
 		 949 aa  911    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.572716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2911  glycine dehydrogenase  50.97 
 
 		 975 aa  901    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2840  glycine dehydrogenase  47.03 
 
 		 948 aa  842    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4000  glycine dehydrogenase  49.59 
 
 		 970 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3590  glycine dehydrogenase  52.09 
 
 		 969 aa  980    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.194839  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4266  glycine dehydrogenase  50.41 
 
 		 948 aa  873    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1016  glycine dehydrogenase  47.33 
 
 		 931 aa  830    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1021  glycine dehydrogenase  50.15 
 
 		 966 aa  926    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5031  glycine dehydrogenase  50.67 
 
 		 974 aa  937    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3329  glycine dehydrogenase  48.97 
 
 		 962 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0624  glycine dehydrogenase  48.77 
 
 		 962 aa  889    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.893513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3058  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 975 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3149  glycine dehydrogenase  48.86 
 
 		 962 aa  886    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1544  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 975 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0131  glycine dehydrogenase  50.76 
 
 		 975 aa  897    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33000  glycine dehydrogenase  49.49 
 
 		 959 aa  892    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68850  glycine dehydrogenase  49.8 
 
 		 958 aa  886    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0764  glycine dehydrogenase  48.15 
 
 		 950 aa  868    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0144  glycine dehydrogenase  50.97 
 
 		 975 aa  901    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18581  glycine dehydrogenase  45.02 
 
 		 969 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3499  glycine dehydrogenase  48.97 
 
 		 962 aa  892    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1222  glycine dehydrogenase  48.27 
 
 		 964 aa  870    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18771  glycine dehydrogenase  44.8 
 
 		 969 aa  814    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21381  glycine dehydrogenase  47.72 
 
 		 968 aa  886    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.102572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2346  glycine dehydrogenase  50.26 
 
 		 942 aa  897    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2709  glycine dehydrogenase  48.05 
 
 		 971 aa  867    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2719  glycine dehydrogenase  49.18 
 
 		 962 aa  900    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.740696  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2884  glycine dehydrogenase  47.03 
 
 		 948 aa  842    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2729  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 966 aa  930    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0797455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3131  glycine dehydrogenase  47.51 
 
 		 950 aa  870    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707314  normal  0.211977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>