57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47258 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47258  predicted protein  100 
 
 
969 aa  2017    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15301  predicted protein  29.21 
 
 
394 aa  129  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
562 aa  69.3  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  24.6 
 
 
634 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
927 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
292 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
292 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 
252 aa  59.7  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
1276 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
732 aa  58.2  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  22.95 
 
 
706 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 
649 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.56 
 
 
1979 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09124  heat shock protein (Sti1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01860)  27.5 
 
 
575 aa  53.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
4079 aa  50.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  21.53 
 
 
1694 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24 
 
 
745 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.74 
 
 
810 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00910  chaperone, putative  30.91 
 
 
584 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
1049 aa  49.7  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.44 
 
 
1056 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.99 
 
 
746 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  26.23 
 
 
338 aa  48.9  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
543 aa  49.3  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3025  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
239 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 
1276 aa  48.5  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.69 
 
 
707 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  31.58 
 
 
889 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 
1192 aa  48.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  25.81 
 
 
582 aa  48.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
1421 aa  48.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
329 aa  47.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25206  predicted protein  25.26 
 
 
477 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00400677  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 
425 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
366 aa  47.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
878 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
713 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.66 
 
 
564 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.59 
 
 
462 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.94 
 
 
818 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  20.69 
 
 
706 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 
286 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63418  predicted protein  30.61 
 
 
404 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316998  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
475 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
286 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.75 
 
 
632 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
301 aa  46.2  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
565 aa  45.8  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 
750 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
547 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45893  predicted protein  24.5 
 
 
565 aa  45.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  19.94 
 
 
392 aa  45.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.04 
 
 
784 aa  45.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.79 
 
 
988 aa  45.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 
286 aa  45.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 
743 aa  45.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.24 
 
 
778 aa  44.3  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>