More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37793 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_37793  predicted protein  100 
 
 
313 aa  641    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  31.67 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  28.96 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  27.35 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0879  Pirin domain protein  28.35 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5419  Pirin domain protein  27.45 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176862  normal  0.0468453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  30.11 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  27.4 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  29.17 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  27.62 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  28.57 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  26.67 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2876  Pirin domain protein  26.8 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  25.1 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  26.64 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  26.07 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  26.42 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  25.67 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  25.67 
 
 
288 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  25.67 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  25.67 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1968  Pirin domain protein  25.51 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.0279036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  24.84 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  29.12 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  25.67 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  25.67 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  23.42 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  25.67 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  28.18 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  31.72 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  33.11 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  27.37 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  27.81 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  30.27 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  31.86 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  28.89 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  28.65 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  27.84 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3049  Pirin, N-terminal  27.69 
 
 
278 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0213029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  24.66 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  32.74 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  25.42 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  35.71 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  25.66 
 
 
285 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28358  RNA pol II transcription cofactor  22.87 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.155514 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  24.14 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  27.32 
 
 
288 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  26.04 
 
 
337 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  26.88 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  26.67 
 
 
290 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  27.97 
 
 
285 aa  59.3  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  25.93 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  27.65 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  27.65 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  24.51 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  27.65 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  25.25 
 
 
290 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  27.8 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  29.74 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  25.82 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  24.47 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  31.82 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  25.1 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  24.61 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  26.91 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7379  Pirin-like  26.22 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3804  Pirin domain protein  26.05 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  25.93 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  25.93 
 
 
290 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  24.22 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  27.42 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  25.51 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  27.74 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  26.61 
 
 
283 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  29.07 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  32.41 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  26.85 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  24.75 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  32.35 
 
 
286 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  25.82 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  24.91 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  25.97 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  25.56 
 
 
322 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  30.09 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  31.78 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  25.66 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  33.03 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  29.14 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5237  Pirin domain protein  28.46 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2516  Pirin domain protein  29.19 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.281399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  26.13 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  24.15 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  26.88 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  28.68 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  27.22 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  24.41 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  26.51 
 
 
286 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  25.83 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  27.75 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  25.82 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>