More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1968 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1968  Pirin domain protein  100 
 
 
290 aa  577  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.0279036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5237  Pirin domain protein  55.19 
 
 
287 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3049  Pirin, N-terminal  51.3 
 
 
278 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0213029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6484  pirin domain-containing protein  51.3 
 
 
283 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3183  hypothetical protein  49.81 
 
 
278 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406067  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5993  pirin domain-containing protein  51.3 
 
 
283 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5628  Pirin-like  51.3 
 
 
283 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7379  Pirin-like  51.48 
 
 
281 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0941  Pirin domain protein  47.81 
 
 
299 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  31.78 
 
 
290 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2436  pirin  44.92 
 
 
130 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  28.39 
 
 
293 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  29.41 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  34.76 
 
 
285 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  32.74 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  31.21 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  29.91 
 
 
293 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  32.05 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  29.53 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  31.18 
 
 
289 aa  89.7  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  30.4 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  28.21 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  34.91 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  29.39 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  28.97 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  34.6 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  27.41 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  29.28 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  27.41 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  27.41 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  32.95 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  29.39 
 
 
293 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  29.44 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  28.63 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  30.74 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  25.97 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  31.74 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  29.96 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  34.46 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  33.17 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  29.7 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  28.57 
 
 
282 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  31.62 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  31.66 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  28.25 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  26.91 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  26.29 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  30.77 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  36.42 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  28.97 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  31.62 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  32.14 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  28.7 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  32.21 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  29.29 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  29.91 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  25.88 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  26.64 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  32.29 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  26.75 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  25.88 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  31.11 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  37.42 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  27.73 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  30.36 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  25.88 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  25.88 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  27.35 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  28.78 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  26.27 
 
 
288 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  29.51 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  30.11 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  27.83 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  33.12 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  28.51 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  28.57 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  32.69 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  35.15 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  30.22 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  32.13 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  30.28 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  28.51 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  31.14 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  28.51 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  32.93 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  36.67 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  32.5 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  28.51 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  28.51 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  25.44 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  28.21 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  28.51 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  28.16 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  27.95 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  28.51 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  28.51 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  36.54 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  30 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  31.1 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>