More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5237 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5237  Pirin domain protein  100 
 
 		 287 aa  577  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3183  hypothetical protein  67.86 
 
 		 278 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3049  Pirin, N-terminal  68.57 
 
 		 278 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0213029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1968  Pirin domain protein  53.33 
 
 		 290 aa  291  8e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.0279036 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6484  pirin domain-containing protein  53.31 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711582 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5993  pirin domain-containing protein  52.61 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5628  Pirin-like  52.61 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7379  Pirin-like  53.66 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0941  Pirin domain protein  49.65 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  30.15 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  32.62 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  32.01 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.37 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  37.89 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  34.87 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  31.02 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  33.05 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  33.05 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  31.42 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2436  pirin  46.67 
 
 		 130 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  29.92 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  33.61 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  27.31 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  31.74 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.48 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  37.43 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  33.06 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  30.99 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  28.24 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  36.84 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  31.14 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  36.84 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  30.7 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  32.6 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  30.77 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  28.85 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  32.7 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  29.13 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  29.74 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  30.83 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  36.13 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  31.33 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  29.57 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  27.69 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  33.86 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  33.64 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  28.26 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  30.27 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  26.15 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  36.21 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  32.1 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  33.15 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  30 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  27.69 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  29.6 
 
 		 284 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  32.89 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  27.83 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  27.83 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  38.35 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  30.5 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  29.93 
 
 		 282 aa  92.4  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  28.26 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  28.26 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  28.26 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  31.05 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  27.39 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  41.28 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  31.53 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  37.96 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  29.13 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  26.64 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  27.64 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  32.86 
 
 		 290 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  32.39 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  32.47 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  29.54 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  30 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  29.25 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  31.44 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  33.64 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  32.39 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  34.26 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  34.26 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  32.35 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  28.63 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  41.12 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  33.5 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  27.78 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  33.62 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  27.83 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  27.31 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  31.47 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  28.26 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  27.31 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  28.4 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  29.13 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  27.31 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  27.31 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  28.26 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>