More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3049 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3049  Pirin, N-terminal  100 
 
 
278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0213029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3183  hypothetical protein  78.42 
 
 
278 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.406067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5237  Pirin domain protein  70.37 
 
 
287 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6484  pirin domain-containing protein  53.56 
 
 
283 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.711582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5628  Pirin-like  52.81 
 
 
283 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5993  pirin domain-containing protein  52.81 
 
 
283 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1968  Pirin domain protein  51.3 
 
 
290 aa  275  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.0279036 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7379  Pirin-like  52.19 
 
 
281 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0941  Pirin domain protein  50.73 
 
 
299 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2436  pirin  50 
 
 
130 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  34.38 
 
 
286 aa  99  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  34.38 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  34.38 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  36.13 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  27.24 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  29.82 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  47.47 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  27.61 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  27.85 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  33.88 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  31.92 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.31 
 
 
310 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  31.33 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  33.67 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  33.04 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  30.71 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  36.53 
 
 
286 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  27.51 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  33.82 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  29.96 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  36.05 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  27.69 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  35.93 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  35.54 
 
 
287 aa  89  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  27.54 
 
 
288 aa  89  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  30.04 
 
 
293 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  38.28 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  27.17 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  25.49 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  29.69 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  34.01 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  30.36 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  31.6 
 
 
285 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  39.64 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  29.34 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  29.41 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  38.39 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  30.24 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  41.44 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  31.55 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  39.64 
 
 
293 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  39.64 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  43.14 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  31.19 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  40 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  27.41 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  36.28 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  32.14 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  31.82 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  28.34 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  29.75 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  28.34 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  28.77 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  38.74 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  28.34 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  44.09 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  28.93 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  29.74 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  40.18 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  29.02 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  32.4 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  28.93 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  31.98 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  38.74 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  38.74 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  27.92 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.74 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  31.25 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  27.84 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  38.74 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  30.73 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  28.84 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  30.69 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  33.67 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  28.51 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  31.47 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  29.82 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  30.4 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  36.36 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  30.74 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  27.71 
 
 
287 aa  82  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  43.62 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  29.17 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  27.8 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  28.45 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  29.44 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3010  pirin-related protein  30.33 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  28.29 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  29.44 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>