More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3010 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3010  pirin-related protein  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2876  Pirin domain protein  33.76 
 
 
250 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  34.51 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  36.48 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  36.47 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  33.33 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  36.47 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  36.47 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01460  pirin, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04510)  33.85 
 
 
310 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.7122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  34.35 
 
 
285 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  35.02 
 
 
299 aa  132  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  34.65 
 
 
292 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2516  Pirin domain protein  34.15 
 
 
262 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.281399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  35.95 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  31.76 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  38.06 
 
 
279 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  34.24 
 
 
285 aa  131  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  34.13 
 
 
286 aa  131  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  34.8 
 
 
309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  35.74 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.86 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  34.77 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  33.21 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  33.6 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  33.2 
 
 
278 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  32.82 
 
 
298 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  31.99 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  32.96 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  31.91 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  34.12 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  32.62 
 
 
320 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  32.96 
 
 
298 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  33.2 
 
 
284 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  33.96 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  32.85 
 
 
290 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  32.85 
 
 
290 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  32.85 
 
 
290 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  33.33 
 
 
337 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  33.33 
 
 
303 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  33.98 
 
 
315 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  33.96 
 
 
290 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  32.68 
 
 
284 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  32.44 
 
 
290 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.4 
 
 
284 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  33.2 
 
 
307 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  32.7 
 
 
290 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  32.7 
 
 
290 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  32.7 
 
 
290 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  32.26 
 
 
274 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.46 
 
 
310 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  32.49 
 
 
290 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  32.49 
 
 
290 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  32.49 
 
 
290 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  32.16 
 
 
284 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  34.11 
 
 
290 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  38.12 
 
 
292 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  33.09 
 
 
300 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  31.3 
 
 
282 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  33.46 
 
 
292 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  33.47 
 
 
285 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01780  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.293563  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  32.68 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  32.52 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  32.82 
 
 
290 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  31.87 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  32.5 
 
 
302 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  31.37 
 
 
284 aa  118  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  33.46 
 
 
324 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  33.33 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34904  predicted protein  32.53 
 
 
301 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  31.87 
 
 
283 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  32.95 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  35.74 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  31.5 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  32.48 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  32.95 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  33.07 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  32.46 
 
 
303 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  31.85 
 
 
312 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1678  Pirin domain protein  29.57 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  32.93 
 
 
299 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  32.17 
 
 
294 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  32.58 
 
 
301 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  31.87 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  33.2 
 
 
293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  31.43 
 
 
337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  32.77 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  31.8 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  32.95 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 
324 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  31.66 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  29.54 
 
 
296 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  32.05 
 
 
342 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  31.34 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  31.52 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  30.89 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  32.59 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  29.69 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  31.27 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>