More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0421 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  594  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  68.47 
 
 		 299 aa  384  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  57.73 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  57.39 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  57.68 
 
 		 294 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  58.08 
 
 		 307 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  58.31 
 
 		 304 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  54.73 
 
 		 316 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  51.9 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  51.9 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  51.56 
 
 		 291 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  47.77 
 
 		 294 aa  265  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  51.38 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  51.22 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  50.52 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  50.17 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  49.83 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  48.95 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  50.71 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  49.13 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  50.52 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  48.26 
 
 		 306 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  47.9 
 
 		 305 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  49.3 
 
 		 305 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  48.61 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  49.83 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  48.44 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  49.66 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  49.83 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  49.48 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  49.48 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  47.92 
 
 		 307 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  51.74 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  49.48 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  50.68 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  50.68 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  50.68 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  50.68 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  50.68 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  47.39 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  47.57 
 
 		 305 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  50.34 
 
 		 293 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  48.3 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  48.77 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  45.99 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  48.62 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  48.96 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  49.48 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  45.33 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  48.61 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  50 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  46.78 
 
 		 306 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  48.78 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  50.68 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  48.79 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  49.65 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  50.35 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  50.35 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  49.65 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  50.18 
 
 		 293 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  46.88 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  45.97 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  46.26 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  41.55 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  46.37 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  45.21 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  47.06 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  40.85 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  44.67 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  43.73 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  42.27 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  43.34 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  45.55 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  41.26 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  43.6 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  43.6 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  46.34 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  42.96 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  43.94 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  41.5 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  45.36 
 
 		 274 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  44.44 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  41.98 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  42.75 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  40.14 
 
 		 311 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  42.03 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  44.83 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  39.79 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  40.07 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  43.82 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  42.46 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  41.64 
 
 		 313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  39.08 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  37.15 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  38.57 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  37.15 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  37.15 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  37.15 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  37.15 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>