More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14161 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_14161  helicase_3  100 
 
 
540 aa  1105    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1511  predicted protein  36.04 
 
 
560 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.485737  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00204  ATP-dependent RNA helicase dbp7 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGX6]  34.91 
 
 
778 aa  282  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60418  ATP-dependent RNA helicase DBP7 (DEAD-box protein 7)  33.22 
 
 
733 aa  279  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.174628 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 
607 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01590  hypothetical protein  31.68 
 
 
948 aa  232  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  30.77 
 
 
589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  30.76 
 
 
609 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  31.33 
 
 
567 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  30.5 
 
 
485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  30.24 
 
 
583 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9989  predicted protein  31.01 
 
 
620 aa  180  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860977  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  33.08 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  31.99 
 
 
765 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.05 
 
 
433 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07420  hypothetical protein  31.67 
 
 
859 aa  169  9e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.592915  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  31.01 
 
 
481 aa  169  9e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  31.91 
 
 
812 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.77 
 
 
433 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  27.69 
 
 
627 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 
433 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.34 
 
 
433 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40877  predicted protein  31.34 
 
 
546 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.94 
 
 
433 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.94 
 
 
433 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.94 
 
 
433 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.94 
 
 
433 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 
433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 
432 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
538 aa  160  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0950  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.89 
 
 
432 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.59 
 
 
441 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.98 
 
 
435 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.96 
 
 
433 aa  157  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1916  hypothetical protein  29.03 
 
 
575 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  29.17 
 
 
644 aa  156  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.68 
 
 
493 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  29.44 
 
 
710 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.85 
 
 
530 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.15 
 
 
607 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  29.44 
 
 
755 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54281  Mitochondrial RNA helicase of the DEAD box family  30.4 
 
 
468 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0633704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.07 
 
 
433 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1950  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.46 
 
 
522 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  29.71 
 
 
467 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.78 
 
 
493 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62830  ATP dependent RNA helicase  27.38 
 
 
617 aa  154  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0490658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
530 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000341148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.19 
 
 
550 aa  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  29.66 
 
 
495 aa  153  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 
808 aa  153  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.86 
 
 
551 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.44 
 
 
529 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.4 
 
 
541 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.19 
 
 
432 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  29.32 
 
 
482 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  29.32 
 
 
482 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  30.77 
 
 
545 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  29.32 
 
 
482 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.32 
 
 
482 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 
546 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.32 
 
 
482 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10782  predicted protein  30.71 
 
 
417 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  29.32 
 
 
481 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.15 
 
 
528 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.989648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  29.32 
 
 
559 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
514 aa  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.75 
 
 
632 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  32.2 
 
 
422 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 
546 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  30.65 
 
 
552 aa  151  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.3 
 
 
537 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.98 
 
 
657 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 
595 aa  150  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87539  pre-mRNA processing RNA-helicase  28.43 
 
 
875 aa  150  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.223181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 
509 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.35 
 
 
571 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.32 
 
 
655 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17862  predicted protein  29.54 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.54 
 
 
625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.82 
 
 
502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.99 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.3 
 
 
493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0808  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.23 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.22 
 
 
712 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0750  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.66 
 
 
463 aa  148  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.97 
 
 
557 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
479 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01970  pre-mRNA splicing factor, putative  27.74 
 
 
1072 aa  148  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.97 
 
 
557 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  29.06 
 
 
398 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  28.88 
 
 
624 aa  148  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.97 
 
 
557 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.39 
 
 
492 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.6 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.6 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
520 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  29.85 
 
 
527 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
520 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>