More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2032 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2032  primosomal protein N'  100 
 
 		 837 aa  1711    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000296827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09963  primosomal protein N' (replication factor Y)  32.78 
 
 		 815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1550  primosomal protein N'  32.11 
 
 		 824 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.764668  normal  0.503728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2035  transcriptional regulator, TrmB  33.14 
 
 		 817 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3377  primosomal protein N'  32.67 
 
 		 831 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6575  primosomal protein N'  32.98 
 
 		 815 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3484  primosomal protein N'  31.6 
 
 		 815 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  31.8 
 
 		 815 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  31.02 
 
 		 832 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  32.82 
 
 		 804 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  30.83 
 
 		 828 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  28.85 
 
 		 802 aa  307  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  31.14 
 
 		 858 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  28.06 
 
 		 802 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  28.06 
 
 		 802 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  31.19 
 
 		 801 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  29.81 
 
 		 804 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  28.43 
 
 		 798 aa  288  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  27.2 
 
 		 801 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  26.91 
 
 		 801 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  31.82 
 
 		 749 aa  285  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  27.14 
 
 		 801 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  27.03 
 
 		 801 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  26.91 
 
 		 801 aa  282  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  28.27 
 
 		 815 aa  282  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  26.69 
 
 		 801 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  26.69 
 
 		 801 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  26.79 
 
 		 801 aa  280  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  26.79 
 
 		 801 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  28.63 
 
 		 812 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1434  primosomal protein N'  30.42 
 
 		 814 aa  278  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0942398 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  28.01 
 
 		 815 aa  277  7e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  26.9 
 
 		 801 aa  276  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  26.77 
 
 		 801 aa  275  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  27.49 
 
 		 914 aa  273  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  29.47 
 
 		 825 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  30 
 
 		 815 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  27.57 
 
 		 790 aa  269  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  26.72 
 
 		 781 aa  268  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  29.82 
 
 		 835 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  27.39 
 
 		 802 aa  265  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  29.09 
 
 		 815 aa  264  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  32.67 
 
 		 768 aa  263  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  31.87 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  25.44 
 
 		 796 aa  261  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1542  primosomal protein N'  27.86 
 
 		 810 aa  261  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.337717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  32.38 
 
 		 813 aa  261  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  27.04 
 
 		 809 aa  260  7e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  28.45 
 
 		 811 aa  260  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  27.78 
 
 		 835 aa  259  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  26.04 
 
 		 798 aa  258  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  29.03 
 
 		 843 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  28.05 
 
 		 848 aa  256  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  28.92 
 
 		 810 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  30.59 
 
 		 745 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  28.67 
 
 		 815 aa  255  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  28.55 
 
 		 868 aa  254  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  30.54 
 
 		 724 aa  254  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  34.41 
 
 		 695 aa  253  7e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  34.4 
 
 		 805 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  32.61 
 
 		 732 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  31.07 
 
 		 738 aa  251  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  33.2 
 
 		 735 aa  251  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0133  replication restart DNA helicase PriA  32.98 
 
 		 715 aa  250  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  26.04 
 
 		 818 aa  249  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  31.4 
 
 		 747 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  30.51 
 
 		 732 aa  248  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  30.15 
 
 		 866 aa  248  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  31.21 
 
 		 661 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  32.17 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2490  primosomal protein N'  31.05 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  30.37 
 
 		 731 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  26.4 
 
 		 803 aa  246  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  31.27 
 
 		 836 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  33.95 
 
 		 821 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0044  primosomal protein N'  32.5 
 
 		 662 aa  244  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2014  primosomal protein N'  32.25 
 
 		 662 aa  244  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  33.52 
 
 		 727 aa  244  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  30.83 
 
 		 780 aa  244  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  31.3 
 
 		 849 aa  244  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  35.8 
 
 		 736 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0061  primosomal protein N'  31.79 
 
 		 806 aa  243  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  27.37 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  30.17 
 
 		 731 aa  242  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0603  primosome assembly protein PriA  32.89 
 
 		 740 aa  241  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0183  primosome assembly protein PriA  33.27 
 
 		 732 aa  241  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  34.58 
 
 		 736 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  33.21 
 
 		 738 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  34.14 
 
 		 752 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  27.27 
 
 		 775 aa  240  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1173  primosomal protein N'  30.81 
 
 		 715 aa  240  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0169  primosome assembly protein PriA  32.95 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  31.94 
 
 		 732 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1711  primosomal protein N'  34.11 
 
 		 794 aa  239  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  32.97 
 
 		 745 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  27.71 
 
 		 810 aa  238  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  32.82 
 
 		 735 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  30.6 
 
 		 731 aa  238  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  31.96 
 
 		 752 aa  238  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  35.31 
 
 		 736 aa  238  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>