27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0678 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  70.91 
 
 		 231 aa  311  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  70.42 
 
 		 231 aa  280  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0254  Type IV secretory pathway AvhB5 protein  41.98 
 
 		 240 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4375  type IV secretion system family protein  33.93 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669124 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5006  type IV secretion system family protein  30 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000746811  normal  0.254693 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  28.12 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  27.36 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  25.87 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  27.23 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  25 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  24.12 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  23.27 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6490  hypothetical protein  63.46 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.721225 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  24.35 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  22.79 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  23.12 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  23.38 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  23.86 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3524  type IV secretion system family protein  21.76 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  22.83 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3644  hypothetical protein  24.38 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.065926 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3816  hypothetical protein  23.26 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.538291  normal  0.123124 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3979  hypothetical protein  23.55 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.869571  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  22.17 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  22.45 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  21.5 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>