22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3317 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  94.07 
 
 		 236 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  66.38 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  66.52 
 
 		 235 aa  314  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  65.07 
 
 		 231 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  66.51 
 
 		 237 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  64.45 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  41.54 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  39.39 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  40.33 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  40.33 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  38.71 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  31.6 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  29.11 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  28.46 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  27.27 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  26.02 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  22.17 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5025  type IV secretion system family protein  27.94 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0212937  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0254  Type IV secretory pathway AvhB5 protein  23.96 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  21.39 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5006  type IV secretion system family protein  24.02 
 
 		 238 aa  42  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000746811  normal  0.254693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>