21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5025 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008771  Veis_5025  type IV secretion system family protein  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0212937  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  35.98 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  30.5 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  32.28 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  29.5 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  29.27 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  28.19 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  30.32 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  29.95 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  29.51 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  28.65 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  27.84 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  24.89 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  27.36 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  27.56 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  28 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  27.64 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  28.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0109  TriD protein  28.72 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08212  conjugal transfer protein TrbJ  24.62 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0254  Type IV secretory pathway AvhB5 protein  27.27 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>