23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1758 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  88.61 
 
 		 237 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  78.79 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  79.25 
 
 		 235 aa  353  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  75.45 
 
 		 236 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  64.45 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  64.59 
 
 		 236 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  38.12 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  38.12 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  37.23 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  38.83 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  39.59 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  36.36 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  36.63 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  27.78 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  26.32 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  24.12 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  27.98 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  30.1 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0254  Type IV secretory pathway AvhB5 protein  23.26 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4375  type IV secretion system family protein  25.36 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669124 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5006  type IV secretion system family protein  24.77 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000746811  normal  0.254693 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5025  type IV secretion system family protein  28.15 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0212937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>