26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4345 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  70.91 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  80 
 
 		 231 aa  304  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0254  Type IV secretory pathway AvhB5 protein  43.48 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5006  type IV secretion system family protein  32.31 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000746811  normal  0.254693 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4375  type IV secretion system family protein  35 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669124 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  28.19 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  28.19 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  31.25 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  29.2 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  25.36 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  27.69 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  27.65 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  27.36 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  24.31 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  29.17 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  28.71 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  27.9 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6490  hypothetical protein  66.07 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.721225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  26.51 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  26.51 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3644  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.065926 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3816  hypothetical protein  24.89 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.538291  normal  0.123124 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3979  hypothetical protein  25.75 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.869571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  24.24 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3524  type IV secretion system family protein  21.99 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>