23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6502 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  87.62 
 
 		 237 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  78.79 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  78.21 
 
 		 236 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  77.63 
 
 		 235 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  65.07 
 
 		 235 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  66.67 
 
 		 236 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  37.83 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  34.4 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  40.49 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  34.56 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  37.77 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  36.23 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  33.33 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  30.18 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  25.63 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  22.79 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  25.41 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  28.7 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4375  type IV secretion system family protein  24.88 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669124 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5006  type IV secretion system family protein  22.62 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000746811  normal  0.254693 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5025  type IV secretion system family protein  29.63 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0212937  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0029  putative conjugal transfer protein  23.32 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>