24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0065 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  98.74 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  45.18 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  41.05 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  38.12 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  33.2 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  33.61 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  37.13 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  34.4 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  40.88 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  40.33 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  30.7 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  36.65 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  28.43 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  26.72 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  28.12 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  27.88 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5025  type IV secretion system family protein  29.5 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0212937  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  27.32 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4375  type IV secretion system family protein  25.22 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669124 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5006  type IV secretion system family protein  25.68 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000746811  normal  0.254693 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  29.22 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0029  putative conjugal transfer protein  27.98 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08212  conjugal transfer protein TrbJ  21.59 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>