21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4198 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  100 
 
 		 236 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  94.07 
 
 		 235 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  67.4 
 
 		 235 aa  317  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  67.39 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  66.67 
 
 		 231 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  66.35 
 
 		 237 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  64.59 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  41.54 
 
 		 254 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  40.88 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  39.59 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  40.88 
 
 		 238 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  38.62 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  31.6 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  29.75 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  28.65 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  26.02 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  28.57 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  22.45 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  23.53 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5025  type IV secretion system family protein  30.32 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0212937  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0254  Type IV secretory pathway AvhB5 protein  24.24 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>