25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0531 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0531  type IV secretion system protein, putative  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6326  P-type DNA transfer protein VirB5  61.21 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0065  type IV secretion system protein VirB5  41.05 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0500304  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0059  P-type DNA transfer protein VirB5  41.05 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4198  P-type DNA transfer protein VirB5  41.54 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3317  type IV secretion system family protein  41.54 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1758  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  37.23 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.291545  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2653  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  41.3 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6502  P-type DNA transfer protein VirB5  37.83 
 
 		 231 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0165  P-type DNA transfer protein VirB5  41.3 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.572956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0452  putative type IV secretion system protein VirB5/TraF  39.67 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1139  P-type DNA transfer protein VirB5  39.36 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0867  type IV secretion system family protein  33.97 
 
 		 238 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7533  type IV secretion system family protein  38.24 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.0576761 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5817  type IV secretion system family protein  33.67 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5025  type IV secretion system family protein  32.28 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0212937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0678  P-type DNA transfer protein VirB5  25.87 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0254  Type IV secretory pathway AvhB5 protein  27.68 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4375  type IV secretion system family protein  28.45 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669124 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4345  type IV secretion system  29.2 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7348  type IV secretion system family protein  27.04 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.260808 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5085  P-type DNA transfer protein VirB5  27.22 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.997151 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a010  conjugal transfer protein VirB5  22.83 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3644  hypothetical protein  24.31 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.065926 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3979  hypothetical protein  23.76 
 
 		 269 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.869571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>