More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0611 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0611  ABC transporter related  100 
 
 		 534 aa  1064    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4017  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  35.32 
 
 		 510 aa  312  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1811  ABC transporter related  38.68 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00289263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  37.45 
 
 		 513 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  37.25 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  35.86 
 
 		 544 aa  299  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.73 
 
 		 499 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  35.73 
 
 		 499 aa  299  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  39.96 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 497 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.73 
 
 		 499 aa  297  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  35.67 
 
 		 544 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  37.02 
 
 		 526 aa  296  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  37.75 
 
 		 523 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  35.8 
 
 		 504 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  33 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  36.14 
 
 		 513 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  33.06 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  33.94 
 
 		 494 aa  292  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.83 
 
 		 522 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  33.98 
 
 		 525 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.68 
 
 		 517 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.45 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  31.35 
 
 		 493 aa  289  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  33.53 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  34.3 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  32.6 
 
 		 501 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5197  ABC transporter related  38.31 
 
 		 540 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  37.68 
 
 		 498 aa  287  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  34.56 
 
 		 514 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 520 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 		 519 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  33.66 
 
 		 523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  36.4 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  35.5 
 
 		 497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  31.5 
 
 		 500 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.96 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  36.14 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  35.47 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  35.63 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  34 
 
 		 525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 		 525 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 		 522 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  37.22 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  30.92 
 
 		 504 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  37.65 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  36.49 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  36.49 
 
 		 499 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  34.18 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  35.48 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  31.99 
 
 		 498 aa  282  1e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  36.38 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 515 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2343  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288241  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  32.33 
 
 		 494 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  30.97 
 
 		 492 aa  281  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  36.49 
 
 		 499 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  37.68 
 
 		 504 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  36.97 
 
 		 499 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  35.43 
 
 		 502 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  37.45 
 
 		 507 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  34.86 
 
 		 516 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  37.04 
 
 		 511 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.85 
 
 		 525 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  33.2 
 
 		 494 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  33.73 
 
 		 509 aa  280  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 		 500 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 516 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  35 
 
 		 528 aa  279  9e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  36.81 
 
 		 504 aa  279  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  34.83 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  34.34 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.39 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  35.42 
 
 		 499 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  32.33 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  35.38 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  35.55 
 
 		 509 aa  277  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  38.1 
 
 		 497 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  31.46 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  33.47 
 
 		 492 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  36.83 
 
 		 500 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  37.35 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  35.22 
 
 		 502 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  35.16 
 
 		 499 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  35.37 
 
 		 499 aa  277  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.91 
 
 		 512 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  33.94 
 
 		 503 aa  276  6e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 499 aa  276  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  37.91 
 
 		 512 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 515 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  36.36 
 
 		 501 aa  276  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  32.47 
 
 		 516 aa  276  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  36.25 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  35.83 
 
 		 501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  32.93 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  33.98 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>