More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2343 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2343  ABC transporter related protein  100 
 
 
518 aa  1014    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288241  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1811  ABC transporter related  43.23 
 
 
516 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00289263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  39.84 
 
 
501 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  39.79 
 
 
520 aa  329  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.01 
 
 
496 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  35.01 
 
 
496 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.01 
 
 
496 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  35.83 
 
 
511 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  36.42 
 
 
505 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  38.35 
 
 
500 aa  315  9e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  34.84 
 
 
501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  36.19 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  35.28 
 
 
500 aa  312  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 
506 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.08 
 
 
506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
541 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  39.16 
 
 
526 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  34.4 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  34.69 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  33.33 
 
 
525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  40 
 
 
495 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  37.65 
 
 
502 aa  307  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  34.46 
 
 
501 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  37.55 
 
 
510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.02 
 
 
522 aa  306  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  36.09 
 
 
497 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  40.35 
 
 
509 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  37.45 
 
 
506 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  38.64 
 
 
498 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  35.91 
 
 
492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  34.72 
 
 
511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  35.49 
 
 
497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  37.98 
 
 
512 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  33.93 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  34.74 
 
 
501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  39.18 
 
 
498 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.84 
 
 
503 aa  303  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  37.45 
 
 
504 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  36.38 
 
 
523 aa  303  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  35.31 
 
 
501 aa  303  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  38.37 
 
 
507 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 
515 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  35.64 
 
 
501 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.12 
 
 
499 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  39.59 
 
 
498 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  35.05 
 
 
501 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  41.26 
 
 
522 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  34.79 
 
 
495 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  36.67 
 
 
506 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  36.97 
 
 
509 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  34.06 
 
 
495 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  35.95 
 
 
514 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  35.05 
 
 
501 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 
517 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.82 
 
 
517 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.82 
 
 
517 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  37.45 
 
 
500 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
505 aa  300  5e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  36.69 
 
 
513 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.67 
 
 
508 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  37.21 
 
 
861 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.57 
 
 
512 aa  300  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 
519 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 
522 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 
525 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  37.68 
 
 
508 aa  299  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  37.79 
 
 
504 aa  299  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  37.48 
 
 
525 aa  299  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3938  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
839 aa  299  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  37.48 
 
 
525 aa  299  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  37.2 
 
 
501 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  36.36 
 
 
512 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  36.36 
 
 
512 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 
499 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  33.8 
 
 
499 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  36.75 
 
 
504 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 
517 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 
515 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 
515 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  33.27 
 
 
505 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  38.16 
 
 
507 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.02 
 
 
512 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.24 
 
 
514 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  37.6 
 
 
528 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  33 
 
 
495 aa  297  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  37.55 
 
 
507 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  36.86 
 
 
515 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  40.32 
 
 
500 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  38.05 
 
 
497 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  36.57 
 
 
513 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  35.17 
 
 
495 aa  296  5e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  37.27 
 
 
501 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  37.53 
 
 
508 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  36.83 
 
 
503 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  37.35 
 
 
505 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 
498 aa  296  8e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
517 aa  296  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>