More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6411 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  96.39 
 
 		 498 aa  967    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  100 
 
 		 498 aa  998    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  74.23 
 
 		 498 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3929  ABC transporter-related protein  52.64 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.992166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3688  ABC transporter related  52.23 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3885  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1593  ABC transporter related  56.06 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0763  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.831413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  48.07 
 
 		 510 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3343  ABC transporter related  50.31 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.94 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.33 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.13 
 
 		 500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.31 
 
 		 861 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 528 aa  348  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  37.83 
 
 		 499 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 499 aa  345  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 		 499 aa  345  8e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.7 
 
 		 496 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  40.12 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  38.01 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  36.47 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  36.84 
 
 		 495 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  36.57 
 
 		 505 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  38.87 
 
 		 501 aa  338  9e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.27 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  36.67 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.11 
 
 		 503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  38.1 
 
 		 511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  38.26 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 496 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.26 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 505 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  40.04 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 508 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 		 505 aa  334  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.18 
 
 		 499 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  36.95 
 
 		 501 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  37.5 
 
 		 511 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  35.98 
 
 		 500 aa  332  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.98 
 
 		 510 aa  332  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  36.79 
 
 		 501 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  36.36 
 
 		 495 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 525 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  35.94 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.34 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  36.95 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  38.8 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.74 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  37.42 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  38.25 
 
 		 515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  37.12 
 
 		 506 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  36.58 
 
 		 513 aa  329  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  36.38 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  36.18 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  36.25 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 523 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.22 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  35.5 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  37.85 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  36.82 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 496 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  36.4 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  38.1 
 
 		 517 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  38.19 
 
 		 516 aa  326  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  38.49 
 
 		 523 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 504 aa  325  9e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  38.29 
 
 		 506 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  39.55 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 		 494 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 		 494 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 		 494 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  36.4 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.56 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 494 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.65 
 
 		 524 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 494 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  37.98 
 
 		 503 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  37.6 
 
 		 513 aa  323  4e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  36.59 
 
 		 516 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.83 
 
 		 513 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  38.02 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  36.95 
 
 		 512 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  37.65 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  36.8 
 
 		 503 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  36.95 
 
 		 512 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  37.65 
 
 		 514 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  36.14 
 
 		 535 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 494 aa  323  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  35.67 
 
 		 501 aa  322  8e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  35.02 
 
 		 494 aa  322  8e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.87 
 
 		 497 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  36.75 
 
 		 503 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  36.29 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  35.63 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  37.15 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>