More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4514 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6411  ABC transporter related  96.39 
 
 
498 aa  967    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000554602  normal  0.729468 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5042  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  75.26 
 
 
498 aa  757    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.650295  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4514  ABC transporter related  100 
 
 
498 aa  1000    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0372056  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3929  ABC transporter-related protein  52.83 
 
 
517 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.992166  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3885  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
509 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3688  ABC transporter related  51.82 
 
 
509 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1593  ABC transporter related  55.85 
 
 
504 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2713  ABC transporter related  47.45 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3343  ABC transporter related  50.31 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589852  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0763  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.831413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
497 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
504 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.73 
 
 
500 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  40.93 
 
 
519 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.1 
 
 
861 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  37.63 
 
 
499 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 
499 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 
499 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  39.07 
 
 
501 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  36.77 
 
 
505 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  38.51 
 
 
511 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  40.12 
 
 
497 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.27 
 
 
503 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  36.84 
 
 
495 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  38.14 
 
 
505 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  38.01 
 
 
525 aa  342  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  36.6 
 
 
501 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
496 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  38.45 
 
 
503 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  36.87 
 
 
501 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  35.5 
 
 
496 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
528 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  38.77 
 
 
525 aa  339  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  37.9 
 
 
511 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
505 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.58 
 
 
499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.06 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  38.06 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  37.15 
 
 
501 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  36.31 
 
 
500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  36.78 
 
 
495 aa  336  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  38.82 
 
 
516 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.54 
 
 
511 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36.8 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  37.42 
 
 
496 aa  335  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  37.17 
 
 
511 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
494 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  37.83 
 
 
516 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.78 
 
 
510 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
494 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
494 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
494 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  35.9 
 
 
501 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  38.96 
 
 
516 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  36.14 
 
 
502 aa  333  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  36.79 
 
 
501 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  36.78 
 
 
513 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  36.58 
 
 
495 aa  333  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  37.3 
 
 
506 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  35.64 
 
 
501 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
494 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  36.58 
 
 
513 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
494 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.75 
 
 
524 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 
523 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 
501 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  36.95 
 
 
512 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  38.38 
 
 
503 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.14 
 
 
501 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  39.63 
 
 
511 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
494 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.76 
 
 
499 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 
508 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.42 
 
 
516 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  36.81 
 
 
509 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
504 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
494 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  36.03 
 
 
496 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  38 
 
 
513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  34.22 
 
 
501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  36 
 
 
501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  35.61 
 
 
498 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  36.74 
 
 
512 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  37.26 
 
 
524 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0058  xylose transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 
510 aa  326  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4100  xylose transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 
510 aa  326  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  37.76 
 
 
523 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  38.01 
 
 
514 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  36.45 
 
 
513 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  35.05 
 
 
510 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.83 
 
 
513 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.63 
 
 
519 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  36.36 
 
 
516 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  38.6 
 
 
518 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0154  xylose transporter ATP-binding subunit  36.58 
 
 
513 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  34.72 
 
 
501 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  36.36 
 
 
516 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 
525 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  34.9 
 
 
492 aa  324  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>