156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0963 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0963  amidohydrolase  100 
 
 
446 aa  901    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.62 
 
 
433 aa  96.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  25 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.6 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  23.58 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  23.43 
 
 
407 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.14 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  22.83 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.7 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.36 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  23.84 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  23.71 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.87 
 
 
433 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.72 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  23.92 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.28 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  24.59 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  23.97 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  22.95 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  24.03 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  26.51 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.24 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  24.15 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.63 
 
 
434 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  24.58 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  25.47 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  25.61 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  23.54 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  22.55 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.65 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  25.98 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  24.48 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  25.6 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  24.51 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  23.57 
 
 
402 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.83 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  24.06 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  24.06 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  24.06 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  26.02 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  23.94 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.64 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24.64 
 
 
407 aa  65.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  24.31 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  25.51 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.29 
 
 
421 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  24.66 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  22.81 
 
 
437 aa  64.3  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  24.37 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.27 
 
 
445 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  24.18 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  24.11 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  22.09 
 
 
1052 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  27.23 
 
 
432 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  25.06 
 
 
421 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  30.21 
 
 
424 aa  60.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  33.33 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  24.55 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  23 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  24.05 
 
 
486 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.25 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  23.3 
 
 
438 aa  58.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  22.27 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  23.13 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1555  amidohydrolase  23.08 
 
 
424 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  23.39 
 
 
419 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  22.88 
 
 
410 aa  56.6  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  29.07 
 
 
394 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.43 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  23.92 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  23.92 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  23.92 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  23.43 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  22.22 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  24.39 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  21.22 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  25 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  23.99 
 
 
424 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  23.74 
 
 
406 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.36 
 
 
423 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  22.3 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  30.34 
 
 
411 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  24.32 
 
 
470 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  25.79 
 
 
381 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  33.09 
 
 
438 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  39.29 
 
 
417 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  28.78 
 
 
370 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  28.32 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  28.32 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  28.11 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  22.22 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  28.99 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  29.41 
 
 
512 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  27.49 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  24.7 
 
 
420 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  21.44 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  22.04 
 
 
480 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  21.77 
 
 
1060 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  23.72 
 
 
413 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  28.3 
 
 
445 aa  50.4  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>