66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2513 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 131 aa  260  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  83.46 
 
 		 129 aa  218  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  51.43 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.5 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.14 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  44.44 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  44.44 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  44.44 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0159  putative DNA uptake protein  40.58 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0106  putative DNA uptake protein  37.68 
 
 		 192 aa  48.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.790621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  41.33 
 
 		 191 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.06 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  42.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4119  putative DNA uptake protein  41.67 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3502  putative DNA uptake protein  38.96 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  38.03 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4010  putative DNA uptake protein  42.86 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  45.45 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2911  putative DNA uptake protein  41.43 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4634  putative DNA uptake protein  38.89 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4003  putative DNA uptake protein  42.11 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860921  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0220  putative DNA uptake protein  36.76 
 
 		 192 aa  42.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.722098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3804  putative DNA uptake protein  42.11 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.472358 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  32.38 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3880  putative DNA uptake protein  42.11 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  34.18 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3926  putative DNA uptake protein  38.89 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  34.18 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  33.75 
 
 		 216 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0244  putative DNA uptake protein  39.29 
 
 		 192 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  41.82 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3794  putative DNA uptake protein  39.29 
 
 		 192 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1491  putative DNA uptake protein  41.07 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2293  putative DNA uptake protein  40.91 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3202  putative DNA uptake protein  39.13 
 
 		 193 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0161749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  34.44 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03996  putative DNA uptake protein  37.5 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4125  putative DNA uptake protein  39.29 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  39.06 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4324  putative DNA uptake protein  39.29 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4192  putative DNA uptake protein  39.29 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0142  putative DNA uptake protein  39.29 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001879  NfuA Fe-S protein maturation  42.42 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4619  putative DNA uptake protein  39.29 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3528  putative DNA uptake protein  37.5 
 
 		 192 aa  40  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>