63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0908 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  71.77 
 
 		 123 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  74.17 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  71.31 
 
 		 121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  68.5 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.32 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.39 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.71 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  35.19 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.18 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 198 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  35 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  31.18 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.92 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.31 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.39 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  30.21 
 
 		 199 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  32.14 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  35 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  32 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  32 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2457  HesB/YadR/YfhF-family protein  30.61 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172331  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  34.72 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  35.06 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.88 
 
 		 286 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  31.71 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  28.41 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0179  putative DNA uptake protein  32.84 
 
 		 192 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  30.99 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2084  HesB/YadR/YfhF-family protein  30.21 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.92431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  32.88 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  34.72 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2172  thioredoxin-like protein  29.17 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  30.86 
 
 		 195 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  32.47 
 
 		 206 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.25 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.8 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  34.92 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  31.51 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  36.36 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  30.67 
 
 		 190 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  28.05 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  28.05 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>