61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3685 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  86.99 
 
 		 119 aa  193  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.63 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  71.77 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.67 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.93 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.48 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  39.13 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.59 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  39.19 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  32.97 
 
 		 199 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.11 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  40 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.43 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.47 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.57 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.05 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  31.46 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.29 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  32.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  29.58 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.21 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.06 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  35.62 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  33.33 
 
 		 199 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  32.18 
 
 		 191 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  34.25 
 
 		 72 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.81 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  36.51 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3881  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  30.38 
 
 		 312 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3713  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3710  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.238496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3819  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3785  putative DNA uptake protein  31.71 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40630  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3445  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0316  putative DNA uptake protein  30.49 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.77 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3750  putative DNA uptake protein  29.89 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28760  NfuA protein  30.14 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  34.67 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0163  putative DNA uptake protein  29.89 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.65 
 
 		 286 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3990  putative DNA uptake protein  29.89 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4233  putative DNA uptake protein  30.12 
 
 		 192 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  33.77 
 
 		 89 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>