36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3369 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
104 aa  210  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.32 
 
 
120 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.93 
 
 
123 aa  99.4  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.85 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.26 
 
 
119 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.59 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.17 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  39.19 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.82 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1256  NifU domain-containing protein  40 
 
 
241 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  37.14 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  36.92 
 
 
246 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 
246 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.66 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.5 
 
 
80 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.94 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  39.44 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.03 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  40.91 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  39.66 
 
 
74 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  38.71 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.25 
 
 
286 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.88 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.1 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  34.85 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  39.62 
 
 
312 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.21 
 
 
73 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.58 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.21 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.38 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.55 
 
 
277 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.38 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.84 
 
 
309 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  35.21 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>