28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0901 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
121 aa  244  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.6 
 
 
123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  72.13 
 
 
120 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.49 
 
 
119 aa  147  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.72 
 
 
125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.56 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.49 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.21 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  39.74 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.31 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.67 
 
 
200 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.71 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  32.14 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  35 
 
 
198 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.21 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1723  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 
204 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.14 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.21 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  37.93 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  34.72 
 
 
72 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.43 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  36.07 
 
 
195 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  30.95 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  26.19 
 
 
286 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  34.25 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  35.21 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  28.92 
 
 
216 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>