47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1999 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1999  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3685  nitrogen-fixing NifU domain protein  90.24 
 
 		 123 aa  214  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0908  nitrogen-fixing NifU domain protein  74.17 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0148  nitrogen-fixing NifU domain protein  73.81 
 
 		 125 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0901  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.49 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3369  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.25 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0039  NifU domain-containing protein  39.39 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.781326  normal  0.020346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3067  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.21 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2513  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  37.84 
 
 		 80 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.47 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.72 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2673  HesB/YadR/YfhF-family protein  34.57 
 
 		 199 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.43 
 
 		 200 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.14 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.93 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 		 183 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  29.58 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  35.14 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01524  protein GntY  31.71 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  34.29 
 
 		 206 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3827  putative DNA uptake protein  33.33 
 
 		 191 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.72 
 
 		 86 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  36 
 
 		 77 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3611  putative DNA uptake protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0299  IscR-regulated protein YhgI  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  34.25 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03218  hypothetical protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00164281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3889  putative DNA uptake protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0299  putative DNA uptake protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00815707  normal  0.0446785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3695  putative DNA uptake protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3795  putative DNA uptake protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4721  putative DNA uptake protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03266  predicted gluconate transport associated protein  31.94 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00179798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.86 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  30.65 
 
 		 286 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  36.51 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  34.43 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  31.34 
 
 		 312 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2202  HesB/YadR/YfhF  30.67 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20209  decreased coverage  0.00866489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1911  hypothetical protein  30.67 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392795  hitchhiker  0.00108913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1847  HesB/YadR/YfhF-family protein  30.67 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000308783 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.47 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0234  putative DNA uptake protein  32.1 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  32.1 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>